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研究人员使用NVIDIA加速创建活细胞模拟

研究人员使用NVIDIA加速创建活细胞模拟

我这样说或许会曝露年龄,但我还记得《孢子》(Spore)这款游戏和当时看到预告片时多么兴奋,它基本上是“神的游戏”(God Game),因为你创造一个小生物体,让它自己经历生命,虽然技术上看起来不一样,但整体工作站的显卡已变得更优,现在还可以用来创建模拟活细胞。 伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校(University of Illinois at Urbana Champaig)研究人员正在利用NVIDIA Titan V和Tesla Volta V100显卡,来创建模拟活细胞,并且在《细胞》(Cell)杂志发表工作原理,本质上来看,它们已经建立一个三维模型,这是一个完全动态的活细胞动力学模型。 研究人员能够观察到细胞经历了氨基酸和核苷的主动运输过程,活细胞如何平衡生长和新陈代谢的需要,让研究人员了解到一个简单的细胞生存规律。 该大学化学教授和活细胞物理中心联合主任再达(Zaida Luthey-Schulten)指出:“即使最小的细胞也需要20亿个原子,如果没有图像处理器(GPU),不可能在现实的生活中做出这样的3D模型。” 她说:“我们发现模拟细胞中出现的基本行为,并不是因为我们编程进去,而是我们在模型中的动力学参数和脂质机制是正确的。” 再达(前者)与她的毕业生赞恩、 本杰明(Benjamin Gilbert)和特洛伊(Troy Brier)。 ...

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